| Collège André BoullocheBart, public | 85 % | 69 % | 493 | 110,3 |
| Collège René CassinBaume-les-Dames, public | 87 % | 74 % | 463 | 104,2 |
| Collège Albert CamusBesançon, public | 92 % | 80 % | 494 | 103,8 |
| Collège DiderotBesançon, public, REP+ | 75 % | 55 % | 659 | 66,5 |
| Collège Les Clairs SoleilsBesançon, public | 83 % | 62 % | 525 | 100,9 |
| Collège ProudhonBesançon, public | 66 % | 48 % | 537 | 93,3 |
| Collège StendhalBesançon, public | 88 % | 82 % | 422 | 100,8 |
| Collège Victor HugoBesançon, public | 90 % | 79 % | 1 037 | 114,2 |
| Collège VoltaireBesançon, public | 80 % | 60 % | 562 | 80,9 |
| Collège privé Sainte-UrsuleBesançon, privé sous contrat | | | 80 | 102,2 |
| Collège Claude LoriusBethoncourt, public, REP+ | 68 % | 47 % | 430 | 72,5 |
| Collège Claude GirardChâtillon-le-Duc, public | 91 % | 80 % | 616 | 119 |
| Collège Lucie AubracDoubs, public | 95 % | 81 % | 658 | 98,5 |
| Collège Émile LaroueFrasne, public | 89 % | 73 % | 319 | 98,6 |
| Collège Paul Élie DuboisL'Isle-sur-le-Doubs, public | 73 % | 64 % | 342 | 101,2 |
| Collège Jean Paul GuyotMandeure, public | 98 % | 88 % | 307 | 91,9 |
| Collège Mont MiroirMaîche, public | 90 % | 79 % | 434 | 94,2 |
| Collège GuynemerMontbéliard, public | 60 % | 46 % | 419 | 85 |
| Collège Lou BlazerMontbéliard, public, REP+ | 64 % | 53 % | 532 | 67,3 |
| Collège Jean-Claude Bouquet - Villers-le-LacMorteau, public | 91 % | 79 % | 869 | 96,8 |
| Collège Pierre VernierOrnans, public | 87 % | 76 % | 457 | 106,8 |
| Collège Olympe de Gouges site de Saint-HyppolytePont-de-Roide-Vermondans, public | 92 % | 71 % | 428 | 98,3 |
| Collège André MalrauxPontarlier, public | 88 % | 76 % | 455 | 101,9 |
| Collège Philippe GrenierPontarlier, public | 83 % | 71 % | 589 | 98,9 |
| Collège Georges PompidouPouilley-les-Vignes, public | 90 % | 77 % | 608 | 119,8 |